アミノ酸の構造
アミノ酸(Amino acids):アミノ酸は図のような基本構造を持っており、炭素原子を中心にアミノ基(-NH2)とカルボキシル基(-CH3)が結合しています。生体を構成するたんぱく質中には20種類のアミノ酸が存在しますが、それらの違いはRの部分に何が結合しているかの違いです。たとえばグリシンはRの部分に水素原子(H)が結合しています。
シスチンとメチオニンは硫黄(S)を含みます。とくにシスチンの硫黄は蛋白内でジスルフィド結合(S-S)を形成し、蛋白の高次構造形成に重要です。
下表に20種類のアミノ酸(R部分のみ)と略号(1文字)を示します。
アラニン (Alanine:A) | アルギニン (Arginine:R) | アスパラギン (Asparagine:N) | アスパラギン酸 (Asparagic acid:D) | シスチン (Cysteine:C) |
グルタミン (Glutamine:Q) | グルタミン酸 (Glutamic Acid:E) | グリシン (Glycine:G) | ヒスチジン (Histidine:H) | イソロイシン (Isoleucine:I) |
ロイシン (Leucine:L) | リジン (Lysine:K) | メチオニン (Methionine:M) | フェニルアラニン (Phenylalanine:F) | プロリン (Proline:P) |
セリン (Serine:S) | スレオニン (Threonine:T) | トリプトファン (Tryptophan:W) | チロシン (Tyrosine:Y) | バリン (Valine:V) |
アミノ酸の立体構造
グリシン以外のアミノ酸にはRの部分に炭素原子が付いています。これによってアミノ酸にはその立体構造からL型(Levorotatory:左:L-form)とD型(Dextrotatory:右:D-form)の2種類の立体構造が存在します。
この2つの構造はちょうどもとの像と鏡に映った鏡像の関係にあり、決して重ね合わせることができません。 これを光学異性体といいます。体を構成する蛋白にはL型のみが存在します。